我刊共有14篇论文入选2013年度“F5000论文”，列表如下：
| 作者 | 单位 | 题目 | 出版年 | 卷 | 期 | 页码 |
| 邵晓梅,王静 | 中国土地勘测规划院 | 小城镇开发区土地集约利用评价研究——以浙江省慈溪市为例 | 2008 | 27 | 1 | 75-81 |
| 吴业,杨桂山,万荣荣 | 中国科学院南京地理与湖泊研究所 | 耕地变化与社会经济发展关系研究进展 | 2008 | 27 | 1 | 90-98 |
| 王静,邵晓梅 | 中国土地勘测规划院 | 土地节约集约利用技术方法研究:现状、问题与趋势 | 2008 | 27 | 3 | 68-74 |
| 李鹤,张平宇,程叶青 | 中国科学院东北地理与农业生态研究所 | 脆弱性的概念及其评价方法 | 2008 | 27 | 2 | 18-25 |
| 胡巍巍,王根绪,邓伟 | 中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所 | 景观格局与生态过程相互关系研究进展 | 2008 | 27 | 1 | 18-24 |
| 刘红光,刘卫东 | 中国科学院地理科学与资源研究所 | 中国工业燃烧能源导致碳排放的因素分解 | 2009 | 28 | 2 | 285-292 |
| 刘涛,曹广忠 | 北京大学 | 城市用地扩张及驱动力研究进展 | 2010 | 29 | 8 | 927-934 |
| 于贵瑞,王秋凤,朱先进 | 中国科学院地理科学与资源研究所 | 区域尺度陆地生态系统碳收支评估方法及其不确定性 | 2011 | 30 | 1 | 103-113 |
| 张利,雷军,李雪梅,高超,曾玮瑶 | 中国科学院新疆生态与地理研究所 | 1997-2007年中国城市用地扩张特征及其影响因素分析 | 2011 | 30 | 5 | 607-614 |
| 孙平军,修春亮,丁四保,魏冶 | 东北师范大学 | 东北地区域发展的非均衡性与空间极化研究 | 2011 | 30 | 6 | 715-723 |
| 王军邦,黄玫,林小惠 | 中国科学院地理科学与资源研究所 | 青藏高原草地生态系统碳收支研究进展 | 2012 | 31 | 1 | 123-128 |
| 薛晔,陈报章,黄崇福,严建武 | 中国科学院地理科学与资源研究所 | 多灾种综合风险评估软层次模型 | 2012 | 31 | 3 | 353-360 |
| 韩翠华,郝志新,郑景云 | 中国科学院地理科学与资源研究所 | 1951-2010 年中国气温变化分区及其区域特征 | 2013 | 32 | 6 | 887-896 |
| 樊杰,周侃,孙威,陈东 | 中国科学院地理科学与资源研究所 | 人文—经济地理学在生态文明建设中的学科价值与学术创新 | 2013 | 32 | 2 | 147-160 |